※為避免混淆，本攻略內的頭目以遊戲內的名稱為準
舞台簡介
LV1
主要舞台：城市之戰
LV2
主要舞台：鋼煉工廠、海岸攻防、雲上戰役、礦山洞窟
隱藏舞台：秘密下水道（前面舞台在遊戲時間4小時內全破）
LV3
主要舞台：噴火山口、海底都市、沙漠風暴、空戰飛船
隱藏舞台：原始叢林（秘密下水道過關）、部落秘境（原始叢林1小時內過關）、跨海大橋（部落秘境過關）
LV4
主要舞台：岩漿地獄、北極冰海、隕石表面、龍捲風內
隱藏舞台：積木空間（以上舞台全破）
LV5
主要舞台：太陽神殿、月亮神殿
隱藏舞台：化學工廠（當凡有在之前加入隊伍才會開啟）
LV6
主要舞台：研究所、次元空間
從以上可知，全部隱藏舞台的解鎖條件幾乎是連鎖在一起的，有一個錯過後面就沒了，但是好在的是條件都很簡單，4小時那個條件也是相當簡單。
LV1與通篇提示
城市之戰
登場頭目：剪刀人（地）、火焰人（火）
登場雜魚：闇火機兵x4、闇土機兵x4
舞台特色：-
勝利條件：敵全滅
敗北條件：全滅&洛克人死亡
本戰是強制戰，雖然可以用洛克人的「跳躍」技能跳離舞台，但是沒有什麼意義與幫助，沒打過這關就不能繼續劇情。
洛克人攻防最強，萊西次之，其他人普普通通，因此戰鬥首要目標分配如下，目標消失後就自由行動：
洛克人：先打頭目，再打闇土機兵
萊西：攻擊闇土機兵
其他人：攻擊闇火機兵
本戰還算簡單，只要不讓洛克人以外的角色衝太前面的話，基本上頭目都會先找洛克人下手，比特由於速度最快，因此會是第一個行動的，但是其攻擊力不足，所以先找最近的闇火機兵攻擊，不管有沒有打倒，戰鬥結束後都要往後退，免得被頭目攻擊，洛克人也不要衝太前面，往前走幾步就好，只要離頭目還有7格距離就OK。
頭目還滿呆的，不會保持距離就往前衝，這就是為什麼洛克人只走幾步就好的原因，如此一來下一次行動時就可打背，進而輕易取勝，其他人也一樣，不讓頭目走過來時還有6點行動值就沒問題（本關頭目的行動值是12），若還是進入頭目戰，則做防禦就好，因為彼此攻防差距太大，不幸被打敗的話沒關係，因為重要角色都不會死，只是離開戰鬥而已，經驗也不是在戰鬥中取得，而是靠在整備畫面中用零件來升級，所以不用擔心。
洛克人進入頭目戰時，就使用特技中的集氣彈來攻擊吧。本戰敵人不多，所以盡情用集氣彈沒關係，若洛克人打完戰鬥後生命不足，記得用艾弟的技能補血，再去打另一個頭目，然而若真被打敗也不用擔心，因為會自動復活一次…懶得用艾弟補血也沒關係…
若發生洛克人敗北事件，除了洛克人會自動復活一次以外，迪歐會在地圖西北方出現來幫助玩家，但是是第三陣營，無法操控，也沒有任何特殊對話或劇情，過關後也不會加入，總之出現得很莫名其妙就是了... 在隱藏舞台「秘密下水道」才會正式登場並且可控。
後面幾關若再度發生洛克人敗北事件，人物會換，LV2時還是迪歐，LV3時是布魯斯，出現地點一樣是地圖西北方（左上角），一樣沒有劇情地亂入，再更後面幾關就沒有了，洛克人敗北直接GAME OVER。
這裡來講講如何迅速提升良心指數來讓頭目加入，戰鬥開始後就清掉全場的敵人，打敗後詢問是否拆解時就拆解，最後只留下一位小兵，然後大家圍攻他，把他打敗後，詢問是否拆解時選放棄，如此一來指數就會上升，接下來小兵會想逃跑，但逃不了，繼續圍攻、放棄拆解、圍攻，總之只要放棄拆解，指數就會增加，加到比開戰時還高後就可拆解。
戰鬥完後劇情跑完就可知道頭目會不會加入，若沒加入表示指數不夠，需要再提升，往後的戰鬥如法炮製，不再贅述。本過程不難，比較麻煩的是良心值不方便比較，各位可以用抓圖軟體拍下開戰時的良心值來比較。
圍攻時建議萊西到別的地方去，然後使用「挖掘」指令（戰鬥>特技>挖掘），因為遊戲前期技術力不足，有些道具無法開發，這時使用挖掘，運氣好的話可以提前得到一些很有力的道具，若能挖到「爆彈」是最好，以後打敵人時會比較輕鬆；如果沒挖到就算了，至少應該能挖到點E罐和電池，這是一個能節省開發零件又免費獲得道具的實用技能。
※最後面幾關會再告訴大家爆彈要用在哪，前期與中期還用不到，別浪費了。
LV2
鋼煉工廠
登場頭目：牡羊座（火）、轟炸人（火）、火力人（火）
登場雜魚：闇火機兵x5、闇火機兵E、闇風機兵x2、闇土機兵x2
舞台特色：在熔鐵與火門旁邊1格會受傷，30秒扣1/20HP
勝利條件：擊敗牡羊座
敗北條件：全滅&洛克人死亡
在進行本舞台前，可先到研究所>生產線中開發4個連技晶片A、2個防禦晶片A、2個分身晶片A、金屬系列全裝備2套（頭手身足），再保險些，開發2個反xx晶片，比如這一關的頭目都是火屬性，那就買2個反火焰晶片，讓頭目的攻擊廢掉。
然後到資料室>個人資料中，幫洛克人和火焰人進行整備，記得連技晶片一個人可以裝2個，因為現在零件還不夠，所以只幫這兩位換就好，以後零件多了就慢慢擴及整個隊伍，至於為什麼沒提到剪刀人？因為火焰人戰鬥能力比較好，所以先把裝備讓給他，剪刀人當輔助角色。
不要使用實驗室＞強化，因為強化太浪費零件，C/P值跟換晶片與裝備比起來非常低。
本舞台建議第一個打，因為火力人與轟炸人是前期較佳的隊友，越早收服越好，一開始我方會出現在舞台右邊，對手陣營在左邊，中間有鐵絲網，但是只有飛行型角色可以通過，因此對於步行型角色來講只有上下兩條路可走，下面是死路，有一位闇火機兵，還站在角落，所以只要派光光與剪刀人2個人下去便可把他關在角落，以利賺良心指數。
鐵絲網上的闇風機兵交由比特解決，闇風機兵都清除後，可轉去攻擊左下側的闇火機兵和闇火機兵E，雖然闇火機兵E比較強，但還不是比特的對手，多戰幾次即可打敗，比較需要注意的是轟炸人可能會想去打比特，若時機不對的話就飛回鐵絲網上，讓轟炸人無從下手，萊西不用動，在原地進行挖掘就好。
剩下就是讓洛克人、火焰人和愛弟往上走，進而深入敵陣，之所以要派這三人，是因為在鐵絲網旁邊和鐵門旁時，非火屬性的角色會受傷，火焰人和愛弟是火屬性，不怕，而洛克人只要轉成火屬性就OK，洛克人與火焰人打頭陣，愛弟在後方不參與戰鬥，幫忙補血就好，在窄道上時可能會有走不太過去的情況，這時先走過去，接著再下一次移動指令即可，快到達左上方時，火力人會走過來，這時算好距離，讓他離我們7格以上，讓他就算走過來也無法開戰，然後再找機會繞到背後或側面攻擊打敗之。若覺得還是有點困難，可讓洛克人故意被火力人打敗（在此之前還是削點火力人的血），以觸發原地復活與迪歐支援事件，讓迪歐來幫忙一下（雖然很快就會被頭目打敗）。
打到後期時注意一下比特的位置，打完雜魚後就走到洛克人與火焰人身後幫忙加速度，最後就是從背後攻擊牡羊座，若想保險些，可以先犧性其他人以消耗牡羊座技力，再讓洛克人給予最後一擊。
雲上戰役
登場頭目：巨蟹座（水）、電流人（風）、發電人（風）
登場雜魚：闇火機兵x2、闇風機兵x5、闇水機兵x2、闇水機兵E
舞台特色：具飛行屬性的角色不受地形影響
勝利條件：擊敗巨蟹座
敗北條件：全滅&洛克人死亡
為了增加有力同伴，接下來建議打這一關。在此之前，先於編隊當中撤下光光，加入火力人與轟炸人，然後再把光光與愛弟的裝備完全轉到火力人與轟炸人身上，因為電流人與發電人的行動值很高（達16）、速度快，技力也比較高（適合發招）將會是非常有力的同伴。
舞台沒有什麼特別需要注意的地方，就是形狀比較支離一點，首先讓洛克人往右走打掉發電人，再往左上迂迴到右上，迂迴的途中應會遇上電流人，主動觸發戰鬥打掉之。
至於其他人就是轟炸人與火力人跟著洛克人一起走以隨時支援，有需要就背靠背前進，免得被頭目找到機會打背，其他人就是四處清雜魚，最後找一隻雜魚做為賺良心指數的目標，星座頭目都不會動的，繞到背後即可輕鬆解決。
海岸攻防
登場頭目：金牛座（地）、冰凍人（水）、冰霜人（水）
登場雜魚：闇風機兵x2、闇土機兵x3、闇水機兵x5、闇水機兵E
舞台特色：-
勝利條件：擊敗金牛座
敗北條件：全滅&洛克人死亡
LV2玩到這裡就比較自由了，打法隨玩家自由發揮。冰凍人與冰霜人能力普通，不值得收，所以這關不用特意去賺良心值，反正玩家上陣人數多只能有8人，收那麼多頭目沒有什麼實際用處，就省點力氣，反正後面還有能力更好的頭目可以收服。接下來只要遵從洛克人打頭目，其他人打雜魚的原則即可。另外，這關下面的冰地可以行走。
礦山洞窟
登場頭目：雙子座（風）、力氣人（地）、金屬人（地）
登場雜魚：闇火機兵x3、闇土機兵x5、闇土機兵E、闇水機兵
舞台特色：針刺地形每30秒扣1/20HP，土屬性不受影響
勝利條件：擊敗雙子座
敗北條件：全滅&洛克人死亡
本舞台的特點就是只有一條路可以通往頭目所在地，途中還有針刺，左上角看似好像有路，但實際上是被封死的，而且一開始就呈現被包圍的狀態，不過都是雜魚，沒啥威脅。氣力人與金屬人能力不佳，可以不收，本關不用特意去賺良心值。至於針刺地形，只要是土屬性或飛行型就不怕，所以把洛克人給轉換成土屬性走過去吧，而力氣人與金屬人也都是土屬性，所以就不要以為他們會被刺傷了，直接衝過去解決掉，在針刺上會有走不太動的情況，多重複下幾次移動指令即可。電流人與發電人可以靠高行動力來快速通過針刺地形，以利支援洛克人，其他人就四處清雜魚即可。雙子座背靠牆壁，所以無法打背，打側面即是。
秘密下水道
登場頭目：雷電人2（風）、冰凍人（水）、力氣人（土）
登場雜魚：闇土機兵x2、闇土機兵E、闇水機兵x4、闇水機兵E
舞台特色：-
勝利條件：敵全滅
敗北條件：全滅&洛克人死亡
本舞台可以使用迪歐，所以共有9人可控，而且看看頭目的名字，都有個"2"，這種的都無法收服，所以本關不用賺良心值，還有一點，這種頭目都不會發招，只會用普通攻擊，所以很好打。
迪歐的處境並沒有如開戰前對話中所說的如此危急，迪歐可以去單挑頭目，就算被打敗也不會造成任務失敗，若玩家還是不放心，可讓迪歐先與主角群合流再說，洛克人可以一人單獨往上單挑雷電人，其他人四處清雜魚便結束本關，之後陣形中把愛弟去掉，換成迪歐。
LV3
噴火山口
登場頭目：獅子座（火）、汽油人（火）、熱氣人（火）
登場雜魚：闇火機兵x4、闇火機兵Ex3、闇風機兵x2、闇土機兵x2
舞台特色：站在岩漿上每30秒扣1/20HP，火屬性不受影響
勝利條件：擊敗獅子座
敗北條件：全滅&洛克人死亡
LV3開始後可先到研究所>生產線根據零件多寡來開發連技晶片B、防禦晶片B、分身晶片B，也別忘了開發各種反xx晶片來使頭目屬性攻擊無效，以提升攻防能力然後就先打本關吧，目的是收服火屬性的熱氣人與汽油人，火屬性頭目在本作都是很不錯的隊友，務必取得。
本關特點是站在岩漿上的話會慢慢損失HP，洛克人一開始就站在岩漿上，所以要早點行動，龜毛點可先換成火屬性，但沒必要，本關最適合作為賺良心指數的雜魚在上面，趁早包圍吧。獅子座本身有會慢慢加HP的晶片，又無法打背，所以要盡可能在短時間內處理掉，打完後，接下來到陣形中把剪刀人和比特換成熱氣人和汽油人，然後打下一關。
空戰飛船
登場頭目：天蠍座（水）、武士人（風）、雷電人（風）
登場雜魚：闇風機兵x3、闇風機兵Ex2、闇複合Cx3
舞台特色：-
勝利條件：擊敗天蠍座
敗北條件：全滅&洛克人死亡
這關一開始就是包圍態勢，但還不是大威脅，威脅比較大的是行動力高達16的雷電人和武士人，但若能收服也是很棒的戰力，一開始洛克人就往前衝，其他人四處清雜魚即是。如果覺得本關還是有點困難，可以暫時放著不打，先打下面兩關這樣。
沙漠風暴
登場頭目：天秤座（風）、鋼鐵人（土）、剪刀人2（土）
登場雜魚：闇火機兵x2、闇火機兵Ex2、闇土機兵x4、闇土機兵Ex3
舞台特色：-
勝利條件：擊敗天秤座
敗北條件：全滅&洛克人死亡
一看到剪刀人2這名字就知道無法收服了，至於鋼鐵人，他能力不行，不收為妙。本關沒什麼特別的，就是天秤座速度比較快（40），可能要犧牲一下其他角色來支援一下洛克人。
海底都市
登場頭目：處女座（土）、結冰人（水）、泡沫人（水）
登場雜魚：水機兵x6、闇水機兵Ex2、闇複合Dx2
舞台特色：除水屬性不受環境影響，其餘屬性行動力減半
勝利條件：擊敗處女座
敗北條件：全滅&洛克人死亡
本關特色是非水屬性的角色在移動與使用特技時，行動力的消耗變成原本的2倍，洛克人可以靠轉換成水屬性來化解，其他非水屬性的角色就沒辦法，不過這對於本關攻略並沒有太大的問題，只是行動變得比較慢而已。洛克人打頭陣衝鋒，其他人清雜魚即可，泡泡人與結冰人能力不佳，可放棄之。
原始叢林
登場頭目：鋼鐵人2（土）、結冰人2（水）
登場雜魚：闇土機兵x3、闇水機兵Ex3、闇複合Ax4
舞台特色：-
勝利條件：敵全滅
敗北條件：全滅&洛克人死亡
本舞台不像之前的下水道一樣不破就不能進人下一LV，而是跟著下一LV一起開放，所以就先來打這一關吧！這裡的頭目的名稱都有2，當然爾無法收服，而且布魯斯成了可控角色，難度也不高，可以迅速清場，只是布魯斯技力太低，可能要備些電池應戰。
部落秘境
登場頭目：法老王人（土）、汽油人2（火）、酋長人（風）
登場雜魚：闇火機兵x3、闇土機兵Ex3、闇複合Bx4
舞台特色：-
勝利條件：敵全滅
敗北條件：全滅&洛克人死亡
玩家可以決定要不要繼續選隱藏舞台，館主建議先把隱藏舞台破完比較好。這關可以嘗試收服酋長人與法老王人，為隊伍注入新血，雖然針刺不少，但寬度大部分只有一格，直接跨過去就好了，可說是沒有意義的設計，打到這裡不要忘了圍攻雜魚賺良心指數。
跨海大橋
登場頭目：爆彈人2（火）、泡沫人2（水）、石頭人2（土）
登場雜魚：闇複合Ax3、闇複合Bx4、闇複合Dx4
舞台特色：-
勝利條件：敵全滅
敗北條件：全滅&洛克人死亡
頭目名字都有2，無法收服，沒什麼地方特別需要注意的一關。
LV4
北極冰海
登場頭目：魔羯座（土）、水壺人（水）、潛水人（水）
登場雜魚：闇水機兵x3、闇水機兵Ex5、闇複合Cx2
舞台特色：角色行動後，會有1格的誤差
勝利條件：擊敗魔羯座
敗北條件：全滅&洛克人死亡
水壺人是水屬性頭目中基本能力最強的，值得收到隊中。本舞台的特色是移動時會隨機偏掉1格，所以有時可能要多調整一下位置，再來，就是要面對本作最強的頭目─摩羯座了！摩羯座攻擊力破百，防禦力更是超過200！就算玩家此時把全員強化到最強，裝備與晶片也使用目前最強的，全員圍攻也是打不贏... 那怎麼辦呢？其實解決方法出乎意料地簡單，有一種道具叫做「爆彈」，可以在大地圖上直接投出，效果是直接扣對手1/4的血 ，所需技術力只要T2，零件數量更是沒什麼要求，在進入本舞台前便開發出若干個吧！但如果之前玩家有勤於讓萊西挖掘的話，理論上這個時候爆彈至少超過6個，給他丟丟丟，最強頭目摩羯座就趴了…其實爆彈戰術每一關都能用，但是太破壞平衡，不建議濫用。
岩漿地獄
登場頭目：射手座（火）、爆彈人（火）、火焰人2（火）
登場雜魚：闇火機兵x3、闇火機兵Ex7
舞台特色：除火風屬性角色以外，每30秒減少1/20的生命
勝利條件：擊敗射手座
敗北條件：全滅&洛克人死亡
爆彈人是一入隊能力就很好的頭目，所以早些取得吧。本舞台的特色是全地形皆為岩漿地形，但是對風屬性與火屬性無效，剛好本作能力較佳的頭目大都是火和風屬性，所以無需傷腦筋，洛克人也僅需要轉一下屬性就沒事了。打爆彈人會發現他名字多了個2，但無須擔心，這是對話框內文字沒校正的問題，所以還是可以收得到的。
龍捲風內
登場頭目：雙魚座（水）、酋長人2（風）、電流人2（風）
登場雜魚：闇風機兵x3、闇風機兵Ex5、闇複合Ax2
舞台特色：每個人的行動力x1.5
勝利條件：擊敗雙魚座
敗北條件：全滅&洛克人死亡
本舞台的起始點在左上角的小崖上，很擠，所以在進入本舞台前最好先把速度高的角色給放在前排，速度低的放在後排，不然在舞台一開始會發生整個隊伍動不了的情況。本舞台特色是每個人的行動力都x1.5，所以可以結束得很快，需注意的是有的頭目有連擊晶片，所以打頭目時注意不要派防禦力太低的去打。
隕石表面
登場頭目：水瓶座（風）、石頭人（土）、隕石人（土）
登場雜魚：闇土機兵x4、闇土機兵Ex5、闇複合Dx2
舞台特色：充滿磁力地形，若裝備金屬裝備，行動會受影響
勝利條件：擊敗水瓶座
敗北條件：全滅&洛克人死亡
如果在本LV一開始就把裝備給全部換掉的話，身上應該是沒有金屬裝備的，沒有金屬裝備的話，本戰可說是非常簡單。
積木空間
登場頭目：佛魯迪（風）、科斯貝爾（風）、法老王人2（土）、騎士人（火）
登場雜魚：闇火機兵Ex2、闇風機兵Ex2、闇土機兵Ex2、闇水機兵Ex2
舞台特色：角色無法使用技能，技力消耗x1.5
勝利條件：敵全滅
敗北條件：全滅&洛克人死亡
本戰需注意只能6個人上陣，所以最弱的2位角色就放在最後面吧。雖然另外還限制了角色使用技能，以及技力消耗x1.5，但是若已經幫全隊換好當前最強裝備的話，並沒有什麼難度可言。
LV5&6
月亮神殿
登場頭目：月之神（風）、骷髏人（風）、巨劍人（土）
登場雜魚：闇土機兵x3、闇土機兵Ex4、闇複合Dx4
舞台特色：-
勝利條件：擊敗月之神
敗北條件：全滅&洛克人死亡
本關是最後一個可以收服頭目的舞台了，骷髏人務必收服，只要打完這一關，以後不用再計較良心指數。雖然舞台有一堆針刺，但是不是一定需要經過的地形，形同虛設。
太陽神殿
登場頭目：太陽神（火）、熱氣人2（火）、騎士人2（火）
登場雜魚：闇火機兵x3、闇火機兵Ex4、闇複合Ax4
舞台特色：-
勝利條件：擊敗太陽神
敗北條件：全滅&洛克人死亡
地形跟月亮神殿一樣，直接往前衝去打倒太陽神就好了。
化學工廠
登場頭目：武士人2（風）、隕石人2（土）、潛水人2（水）
登場雜魚：?
舞台特色：全舞台每30秒減少1/20的生命，無視屬性通吃
勝利條件：敵全滅
敗北條件：全滅&洛克人死亡
本舞台開啟條件仍是謎，與凡加入與否無關，只知道對玩家來講應該還是相當簡單的。
研究所
登場頭目：威利機器α（無）、火力人2（火）、冰霜人（水）、發電人（風）、金屬人（土）
登場雜魚：闇火機兵Ex3、闇風機兵Ex3、闇土機兵Ex3、闇水機兵Ex3
舞台特色：-
勝利條件：擊敗威利機器α
敗北條件：全滅&洛克人死亡
進度到這裡，又有更強的裝備與晶片可以開發了！如果前面化學工廠有過關，就能開發終極系列的裝備，若沒有，就只能開發到原子系列裝備，不過沒關係，原子系列也很夠強了。晶片方面就開發連技晶片C、防禦晶片B、分身晶片B、渦輪加速晶片。這一關只能有6人上陣，但是沒有關係，直接衝到最前面幹掉威利，只派洛克人一人上陣也沒問題！
次元空間
登場頭目：威利膠囊α（無）轟炸人2（火）、巨劍人2（土）、水壺人2（水）、骷髏人（風）
登場雜魚：闇複合Ax3、闇複合Bx3、闇複合Cx3、闇複合Dx3
舞台特色：每5分鐘打亂全部角色位置
勝利條件：擊敗威利膠囊α
敗北條件：全滅&洛克人死亡
最後一關。雖然說每5分鐘會打亂全部角色的位置，但是可以只派洛克人上陣，然後靠連擊晶片C的淫威直接打威利，不到5分鐘就可結束本關…很沒意思的最終戰。
ROCKMAN STRAGEY PROJECT
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